北京林業大學林木分子育種創新團隊在全球率先開展植物假基因的發現與功能解析,研究成果近期在線發表于生物學top期刊《The Plant Cell》(5年if:9.378)。該研究為解析植物基因組復雜非編碼序列功能提供了重要理論指導和技術支持。
基因組中2%的DNA用來編碼蛋白質,剩余98%的序列通常被認為是物種基因組進化過程中產生的無功能“垃圾DNA(Junk DNA)”。其中,假基因是*典型的“垃圾 DNA”,在林木及其他植物基因組中占較大比例。
假基因真的沒有功能嗎?圍繞這個問題,團隊開發了一套適合搜索植物基因組假基因序列的編程軟件(PlantPseudo),鑒定了重要模式樹種楊樹等7個植物基因組的假基因序列。在楊樹基因組中共鑒定出2.4萬條假基因,約是真基因數目的一半,其他植物同樣如此。將假基因與基因組的調控序列比對發現,基因組很大比例的調控序列集中在假基因周圍。這表明假基因并不是無用序列,它們在基因組中具有調控功能,起到了維持植物細胞正常新陳代謝的作用。
該研究得到國家重點研發計劃課題與國家自然科學基金項目等項目聯合支持。生物學院副教授謝劍波為論文*作者,張德強教授為通訊作者,青年教師劉小敏,博士生李英、趙怡陽,團隊成員李百煉教授與瑞典植物科學研究中心Par Ingvarsson教授參與了研究的具體實驗與論文修訂工作。
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