小蔥生長期間主要是蟲害,如地蛆、棉鈴蟲。病害較少,在秋雨大的年份有灰霉病。為防止 地蛆的發生,在播種前及蔥苗出土后10天各噴1次300~500倍的敵百蟲,或在定植前用500 倍的敵百蟲溶液浸蘸蔥根,這樣可有效防止地蛆的發生。苗期還要防治棉鈴蟲的危害,在孵化期至二齡期,幼蟲尚未蛀入蔥葉內時施藥,可選用21%滅殺斃600倍液,2.5%功夫乳油5 000?倍液。如果秋季雨水大的年份易發生灰霉病,可用克霉靈500倍液或50%萬霉靈800倍液交替噴藥防治;在扣棚膜、去枯葉后,用800倍的萬霉靈噴1遍,可有效防止灰霉病的發生。